CHAMPAIGN, Ill. – A valaha készített legrészletesebb szarvasmarhagén-térkép, valamint a szarvasmarha- és emberi genomok első összehasonlító térképe azt mutatja, hogy sok gén, sőt egész kromoszóma is ugyanúgy van beállítva a két fajban, tudósok jelentése.
"Az összehasonlító térképnek óriási előrejelző ereje van" - mondta Harris Lewin, a kutatás vezetője, a W.M. Keck Összehasonlító és Funkcionális Genomikai Központ az Illinoisi Egyetemen.
"Első alkalommal léphetünk át az emberi genom egy pontjáról a szarvasmarha genom egyenértékű pontjára.Ez lehetővé teszi számunkra, hogy az egyik faj térképét felhasználjuk a másik faj fontos tulajdonságait irányító gének azonosítására, például a laktációt, a szaporodást és a fertőző betegségekkel szembeni rezisztenciát befolyásoló géneket."
A térképek a Genome Research folyóirat szeptemberi számában jelentek meg, két egyetem tudósai egy hároméves együttműködést követően, amelyet Lewin állattudományok professzora, a Gutgsell-diploma tulajdonosa és az UI Biotechnology igazgatója vezetett. Központ. A kutatás főbb közreműködői között szerepelt Mark R. Band társszerzők, posztdoktori kutató munkatárs; Joshua H. Larson, az UI állattudományi tanszék végzős hallgatója; és James E. Womack, a W.P. Luse feljogosított professzor a Texas A&M Egyetemen.
Az összehasonlító térkép kihúzható posztere megtalálható a folyóiratban az AniGenics Inc., egy állatgenomikai vállalat és a Research Genetics, a genomkutatáshoz szükséges eszközök és reagensek fő szállítója, valamint az Invitrogen Corp. leányvállalata jóvoltából.
A kutatás – amelyet az USDA National Research Initiative finanszírozott – a gének kis szegmenseinek, úgynevezett expresszált szekvencia-címkék szekvenálását és a felhasználói felületen kifejlesztett kifinomult bioinformatikai eszközöket kombinálta egy sugárzáshibrid sejtpanellel, amely egyedülálló erőforrás géntérképezést a Womack laboratóriuma fejlesztett ki.
Összesen 1087 genetikai markert helyeztek el a sugárzáshibrid térképen, amely 768 ismert gént tartalmaz. A szarvasmarha kromoszómális DNS-ének körülbelül 92 százaléka szerepel a térképen. Ez négyszeres növekedést jelent a korábban feltérképezett összes szarvasmarha-gén számában, mondta Lewin.
Az ismert gének közül 638 (83 százalék) azonosítható az emberi kromoszómák helyzeti információival rendelkező emberi génekkel – jelentették a kutatók. Az emberek és szarvasmarhák kromoszómáiban ugyanazon gének sorrendjének ismerete lehetővé tette az első "teljes genom összehasonlító térképének" elkészítését, és a génrend nagy konzerválódási régióit tárta fel a két genomban.Az összehasonlító térkép vizsgálata 149 konzervált kromoszómaszegmenst tárt fel emberben és szarvasmarhában, köztük négy teljes kromoszómát, amelyek úgy tűnik, hogy mindkét fajban ugyanazokkal a génekkel rendelkeznek, annak ellenére, hogy a két fajt több mint 60 millió éves evolúció választja el egymástól.
A jelentésben többek között 48 új gén azonosítása, 48 feltérképezetlen emberi gén előrejelzett feltérképezése volt a szarvasmarha-térkép pozíciója alapján, valamint az evolúció során bekövetkezett kromoszóma-átrendeződések száma, amelyek a jelenet eredményezték. a szarvasmarha és az emberi genom szerveződése.
Lewin szerint a szarvasmarha genomja végül teljesen meg lesz szekvenálva, ami végül részletesebb képet ad az evolúciós eseményekről, amelyek megkülönböztetik a különböző emlősöket. "A végén" - mondta - "meg fogjuk érteni az emlősök közötti jelentős fenotípusbeli különbségek molekuláris genetikai alapját. Ennek óriási tudományos és gyakorlati jelentősége lesz, különösen az élelmiszerbiztonság, az állategészségügy és a mi versenyképességünk területén. hazai marha- és tejipar."
